单细胞ATAC测序
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Q&A
单细胞ATAC-seq就是从单细胞水平上研究染色质开放性，主要用于转录调控序列的检测，结合单细胞RNA-seq,可以分析出基因组中所有活跃转录的调控序列。该技术已经被广泛应用于多个研究领域，例如:肿瘤异质性研究、基因调控网络分析、细胞谱系示踪、生物标记物发现等。
ATAC-Seq(Assay for Transposase Accessible Chromatin with high-throughput sequencing)主要利用Tn5转座酶，对某种特定时空下开放的核染色质区域进行切割，然后添加引物进行高通量测序，进而取得在该特定时空下基因组中所有活跃转录的调控序列。
ATAC-Seq原理图
单细胞ATAC-Seq技术依托10x Genomics平台核心的微流控技术，将序列标签区分群体中不同细胞的特征与ATAC-Seq技术相结合，从而为成千上万个单细胞构建染色质可接近性图谱。
10x Genomics单细胞ATAC-Seq原理图
样本类型
细胞系、原代细胞、新鲜和冰冻组织等。
实验流程
10x Genomics单细胞ATAC-Seq实验流程
分析流程
单细胞ATAC分析流程图
应用方向
a.研究细胞异质性;
b.探索生物标志物;
c.定义细胞类型;
d.构建基因调控网络。
产品优势
a.可检测单细胞转录调控区域中的开放染色质;
b.每个通道可容纳500~10000个细胞核;
c.细胞核捕获率高达65%;
d.适用于细胞系、原代细胞、新鲜和冻存样本的研究;
e.运用10x官方软件，可对单细胞基因调控进行精细化分析。
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