靶向代谢组学
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Q&A
靶向代谢组学分析主要是以标准品为参照，对指定列表的代谢产物，特别针对一种或几种途径的代谢产物进行有针对性地、特异性地检测与分析。
靶向代谢组学分析成功的关键因素是准确度、高通量和可靠性。虽然这类分析比代谢谱分析更为常规，但必须面对非常大量(成千上万)的样品。
靶向代谢组学可以应用于：
(1)验证由发现代谢组学实验提出的假说;
(2)进行基于假说的探索性实验(通常根据最新的解释)，针对特定代谢物，研究代谢模型。
基本研究流程
靶向代谢组学研究流程主要可分为样品收集、标准曲线建立、代谢物提取和分离、上机检测和数据分析等。
样本类型
血清 • 血浆 • 尿样 • 脑脊液 • 唾液 • 粪便 •微生物 • 细胞 • 植物 • 组织 • 其它
服务周期
靶向代谢组学服务和周期见下表：
|
平台 |
仪器型号 |
代谢物 |
化合物数目 |
检测周期 |
检测价格 |
|---|---|---|---|---|---|
|
GC-MS/MS |
Aglient 7890A-5975C或8890-7010B |
短链脂肪酸 |
11种短链脂肪酸 |
约15个工作日 |
请询价 |
|
游离脂肪酸 |
37种游离脂肪酸 |
||||
|
UHPLC-QqQ MS |
SCIEX QTRAP 4500或Triple Quad 4500 |
维生素 |
12种水溶性 |
约20个工作日 |
请询价 |
|
氨基酸 |
32种氨基酸 |
||||
|
神经递质 |
27种神经递质 |
||||
|
植物激素 |
10种植物激素 |
||||
|
胆汁酸 |
48种胆汁酸 |
||||
| 辅酶 | 18种辅酶 | ||||
| 抗生素 | 105种抗生素 |
|
序号 |
中文名称 |
英文名称 |
分子式 |
CAS号 |
相对分子质量 |
|---|---|---|---|---|---|
|
1 |
乙酸 |
acetic acid |
C2H4O2 |
64-19-7 |
60.05 |
|
2 |
丙酸 |
propionic acid |
C3H6O2 |
79-09-4 |
74.08 |
|
3 |
异丁酸 |
isobutyric acid |
C4H8O2 |
79-31-2 |
88.11 |
|
4 |
丁酸 |
n-butyric acid |
C4H8O2 |
107-92-6 |
88.11 |
|
5 |
异戊酸 |
isovaleric acid |
C5H10O2 |
503-74-2 |
102.13 |
|
6 |
戊酸 |
n-valeric acid |
C5H10O2 |
109-52-4 |
102.13 |
|
7 |
4-甲基戊酸 |
4-methylvaleric acid |
C6H12O2 |
646-07-1 |
116.16 |
|
8 |
正己酸 |
hexanoic acid |
C6H12O2 |
142-62-1 |
116.15 |
|
9 |
2-甲基己酸 |
2-methylhexanoic acid |
C7H14O2 |
4536-23-6 |
130.18 |
|
10 |
正庚酸 |
n-heptylic acid |
C7H14O2 |
111-14-8 |
130.18 |
|
11 |
正辛酸 |
n-octanoic acid |
C8H16O2 |
124-07-2 |
144.21 |
|
编号 |
中文名称 |
英文名称 |
简写 |
|---|---|---|---|
|
1 |
丁酸 |
butyric acid |
C4:0 |
|
2 |
己酸 |
caproic acid |
C6:0 |
|
3 |
辛酸 |
caprylic acid |
C8:0 |
|
4 |
癸酸 |
capric acid |
C10:0 |
|
5 |
十一烷酸 |
undecanoic acid |
C11:0 |
|
6 |
月桂酸 |
lauric acid |
C12:0 |
|
7 |
十三烷酸 |
tridecanoic acid |
C13:0 |
|
8 |
十四酸 |
myristic acid |
C14:0 |
|
9 |
十四碳烯酸 |
myristoleic acid |
C14:1n5 |
|
10 |
十五烷酸 |
pentadecanoic acid |
C15:0 |
|
11 |
顺-10-十五碳烯酸 |
cis-10-pentadecenoic acid |
C15:1n5 |
|
12 |
棕榈酸 |
palmitic acid |
C16:0 |
|
13 |
棕榈油酸 |
palmitoleic acid |
C16:1n7 |
|
14 |
十七烷酸 |
heptadecanoic acid |
C17:0 |
|
15 |
顺-10-十七烯酸 |
cis-10-heptadecenoic acid |
C17:1n7 |
|
16 |
硬脂酸 |
stearic acid |
C18:0 |
|
17 |
反油酸 |
elaidic acid |
C18:1n9t |
|
18 |
油酸 |
oleic acid |
C18:1n9c |
|
19 |
反亚油酸 |
linolelaidic acid |
C18:2n6t |
|
20 |
亚油酸 |
linoleic acid |
C18:2n6c |
|
21 |
γ-亚麻酸 |
r-linolenic acid |
C18:3n6 |
|
22 |
α-亚麻酸 |
α-linolenic acid |
C18:3n3 |
|
23 |
花生酸 |
arachidic acid |
C20:0 |
|
24 |
顺-11-二十碳烯酸 |
cis-11-eicosenoic acid |
C20:1 |
|
25 |
顺-11,14-二十碳二烯酸 |
cis-11,14-eicosadienoic acid |
C20:2 |
|
26 |
顺-8,11,14-二十碳三烯酸 |
cis-8,11,14-eicosatrienoic acid |
C20:3n6 |
|
27 |
花生四烯酸 |
arachildonic acid |
C20:4n6 |
|
28 |
二十一烷酸 |
heneicosanoic acid |
C21:0 |
|
29 |
顺-11,14,17-二十碳三烯酸 |
cis-11,14,17-eicosatrienoic acid |
C20:3n3 |
|
30 |
顺-5,8,11,14,17-二十碳三烯酸 |
cis-5,8,11,14,17-eicosatrienoic acid |
C20:5n3 |
|
31 |
山萮酸 |
behenic acid |
C22:0 |
|
32 |
芥酸 |
erucic acid |
C22:1n9 |
|
33 |
顺-13,16-二十二碳二烯酸 |
cis-13,16-docosadienoic acid |
C22:2 |
|
34 |
三十烷酸 |
tricosanoic acid |
C23:0 |
|
35 |
顺-4,7,10,13,16,19-二十二碳六烯酸 |
cis-4,7,10,13,16,19-docosahexaenoic acid |
C22:6n3 |
|
36 |
二十四碳酸 |
lignceric acid |
C24:0 |
|
37 |
神经酸 |
nervonic acid |
C24:1n9 |
|
编号 |
物质名称 |
英文名称 |
分子量 |
|---|---|---|---|
|
1 |
VB1硫胺素 |
thiamine |
264.35 |
|
2 |
VB2核黄素 |
Riboflavin |
376.36 |
|
3 |
VB3烟酰胺 |
Nicotinamide |
122.12 |
|
4 |
VB5泛酸 |
(R)-pantothenicacid |
219.24 |
|
5 |
VB6吡哆胺 |
pyridoxamine |
168.19 |
|
6 |
VB6吡哆醇 |
Pyridoxine |
169.18 |
|
7 |
VB6吡哆醛 |
pyridoxal |
167.16 |
|
8 |
VB7生物素 |
Biotin |
244.31 |
|
9 |
VB9叶酸 |
folic acid |
441.40 |
|
10 |
VB12钴胺素碎片 |
Vitamin B12 |
1355.37 |
|
11 |
对氨基苯甲酸 |
p-aminobenzoic acid |
137.14 |
|
12 |
硫辛酸 |
thioctic acid |
206.33 |
|
编号 |
中文名称 |
英文名称 |
缩写 |
|---|---|---|---|
|
1 |
丙氨酸 |
alanine |
ALA |
|
2 |
肌氨酸 |
sarcosine |
SAR |
|
3 |
甘氨酸 |
glycine |
GLY |
|
4 |
α-氨基丁酸 |
α-aminobutyric acid |
ABA |
|
5 |
缬氨酸 |
valine |
VAL |
|
6 |
β-氨基异丁酸 |
β-aminobutyric acid |
β-AIB |
|
7 |
亮氨酸 |
leucine |
LEU |
|
8 |
别异亮氨酸 |
allo-isoleucine |
aILE |
|
9 |
异亮氨酸 |
isoleucine |
ILE |
|
10 |
苏氨酸 |
threonine |
THR |
|
11 |
丝氨酸 |
serine |
SER |
|
12 |
脯氨酸 |
proline |
PRO |
|
13 |
天冬酰胺 |
asparagine |
ASN |
|
14 |
硫代脯氨酸 |
thioproline |
TPR |
|
15 |
天冬氨酸 |
aspartic acid |
ASP |
|
16 |
蛋氨酸 |
methionine |
MET |
|
17 |
羟基脯氨酸 |
4-hydroxyproline |
4-HYP |
|
18 |
谷氨酸 |
glutamic acid |
GLU |
|
19 |
苯丙氨酸 |
phenylalanine |
PHE |
|
20 |
α-氨基己二酸 |
ɑ-aminoadipic acid |
AAA |
|
21 |
α-氨基庚二酸 |
ɑ-aminopimelic acid |
APA |
|
22 |
谷氨酰胺 |
glutamine |
GLN |
|
23 |
鸟氨酸 |
ornithine |
ORN |
|
24 |
甘氨酰-脯氨酸（二肽） |
glycyl-proline |
GPR |
|
25 |
赖氨酸 |
lysine |
LYS |
|
26 |
组氨酸 |
histidine |
HIS |
|
27 |
羟基赖氨酸 |
hydroxylysine |
HLY |
|
28 |
酪氨酸 |
trrosinre |
TYR |
|
29 |
脯氨酸-羟基脯氨酸（二肽） |
proline-hydroxyproline |
PHP |
|
30 |
色氨酸 |
tryptophan |
TRP |
|
31 |
胱硫醚 |
cystathionine |
CTH |
|
32 |
胱氨酸 |
cystine |
C-C |
|
编号 |
中文名字 |
英文名字 |
缩写 |
分类 |
CAS号 |
|---|---|---|---|---|---|
|
1 |
色胺 |
Tryptamine |
- |
单胺类吲哚类 |
61-54-1 |
|
2 |
5-羟色胺 |
Serotonin hydrochloride |
5-HT |
单胺类吲哚类 |
153-98-0 |
|
3 |
5-羟吲哚乙酸 |
5-hydroxyindoleacetic acid |
5HIAA |
单胺类吲哚类 |
54-16-0 |
|
4 |
犬尿喹啉酸 |
Kynurenic acid |
KYNA |
单胺类吲哚类 |
492-27-3 |
|
5 |
褪黑激素 |
Melatonin |
- |
单胺吲哚类 |
73-31-4 |
|
6 |
5-羟基色氨酸 |
5-Hydroxy-Tryptophan |
5-HTP |
单胺吲哚类 |
4350-09-8 |
|
7 |
肾上腺素 |
Epinephrine |
EP |
单胺类儿茶酚胺类 |
329-63-5 |
|
8 |
去甲肾上腺素 |
noradrenaline bitartrate |
NE |
单胺类儿茶酚胺类 |
108341-18-0 |
|
9 |
多巴胺 |
Dopamine |
DA |
单胺类儿茶酚胺类 |
62-31-7 |
|
10 |
高香草酸 |
homovanillic acid |
NMN |
单胺类儿茶酚胺类 |
306-08-1 |
|
11 |
香草扁桃酸 |
4-hydroxy-S-methoxymandelic acid |
VM-A |
单胺类儿茶酚胺类 |
55-10-7 |
|
12 |
去甲变肾上腺素 |
rac Normetanephrine |
- |
单胺类儿茶酚胺类 |
1011-74-1 |
|
13 |
3-甲氧酪胺 |
3-Methoxy-p-tyramine |
- |
单胺类儿茶酚胺类 |
1477-68-5 |
|
14 |
酪胺 |
Tyramine |
- |
单胺类儿茶酚胺类 |
51-67-2 |
|
15 |
二羟苯乙酸 |
3,4-Dihydroxyphenylacetic acid |
DOPAC |
单胺类儿茶酚胺类 |
102-32-9 |
|
16 |
胆碱 |
Choline Chloride |
- |
单胺类胆碱类 |
67-48-1 |
|
17 |
乙酰胆碱 |
Acetylcholine |
Ach |
单胺类胆碱类 |
60-31-1 |
|
18 |
组胺 |
Histamine |
- |
氨基酸类 |
51-45-6 |
|
19 |
犬尿氨酸 |
Kynurenine |
- |
氨基酸类 |
2922-83-0 |
|
20 |
谷氨酰胺 |
Glutamine |
GLN |
氨基酸类 |
56-85-9 |
|
21 |
谷氨酸 |
Glutamic Acid |
GLU |
氨基酸类 |
56-86-0 |
|
22 |
4-氨基丁酸 |
4-Aminobutyric Acid |
GABA |
氨基酸类 |
56-12-2 |
|
23 |
酪氨酸 |
Tyrosine |
TYR |
氨基酸类 |
60-18-4 |
|
24 |
精氨酸 |
Arginine |
Arg |
氨基酸类 |
74-79-3 |
|
25 |
组氨酸 |
Histidine |
HIS |
氨基酸类 |
71-00-1 |
|
26 |
苯基丙氨酸 |
Phenylalanine |
PHE |
氨基酸类 |
63-91-2 |
|
27 |
色氨酸 |
Tryptophan |
TRP |
氨基酸类 |
73-22-3 |
|
编号 |
中文名 |
英文名 |
简称 |
|---|---|---|---|
|
1 |
反-玉米素 |
Trans-Zeatin |
t-ZT |
|
2 |
赤霉素 |
Gibberellin A3 |
GA3 |
|
3 |
吲哚乙酸 |
3-Indoleacetic acid |
IAA |
|
4 |
水杨酸 |
Salicylic acid |
SA |
|
5 |
茉莉酸 |
Jasmonic acid |
JA |
|
6 |
脱落酸 |
Abscisic acid |
ABA |
|
7 |
吲哚丁酸 |
3-Indolebutyric acid |
IBA |
|
8 |
6-苄氨基嘌呤 |
6-Benzylaminopurine |
6-BA |
|
9 |
茉莉酸甲酯 |
Methyl jasmonate |
JA-ME |
|
10 |
激动素 |
6-Furfurylaminopurine |
6-KT |
|
编号 |
简称 |
常用名 |
编号 |
简称 |
常用名 |
|---|---|---|---|---|---|
|
1 |
DLCA |
Dehydrolithocholic acid |
25 |
3β-CA |
3β-Cholic Acid |
|
2 |
LCA |
Lithocholic acid |
26 |
α-MCA |
α-Muricholic acid |
|
3 |
ILCA |
Isolithocholic acid |
27 |
12-DHCA |
12-Dehydrocholic acid |
|
4 |
NDCA |
23-Nordeoxycholic acid |
28 |
λ-MCA （HCA) |
λ-Muricholic acid |
|
5 |
6-KLCA |
6-Ketolithocholic acid |
29 |
CA |
Cholic acid |
|
6 |
7-KLCA |
7-Ketolithocholic acid |
30 |
AlCA |
Allocholic acid |
|
7 |
12-KLCA |
12-Ketolithocholic acid |
31 |
GLCA |
Glycolithocholic acid |
|
8 |
ApCA |
Apocholic acid |
32 |
GCDCA |
Glycochenodeoxycholic acid |
|
9 |
MoCA |
Murocholic acid |
33 |
TLCA |
Taurolithocholic acid |
|
10 |
TCDCA-d5 |
Taurochenodeoxycholic-d5 acid |
34 |
GHDCA |
Glycohyodeoxycholic acid |
|
11 |
β-HDCA |
β-Hyodeoxycholic Acid |
35 |
GDHCA |
Glycodehydrocholic acid |
|
12 |
UDCA |
Ursodeoxycholic acid |
36 |
λ-GMCA (GHCA) |
Glyco-λ-muricholic acid |
|
13 |
CDCA |
Chenodeoxycholic acid |
37 |
TDCA |
Taurodeoxycholic acid |
|
14 |
DHCA |
Dehydrocholic acid |
38 |
GUDCA |
Glycoursodeoxycholic acid |
|
15 |
HDCA |
Hyodeoxycholic acid |
39 |
TUDCA |
Tauroursodeoxycholic acid |
|
16 |
IDCA |
Isodeoxycholic acid |
40 |
THDCA |
Taurohyodeoxycholic acid |
|
17 |
NCA |
23-Norcholic acid |
41 |
TCA |
Taurocholic acid |
|
18 |
DCA |
Deoxycholic acid |
42 |
GDCA |
Glycodeoxycholic acid |
|
19 |
DiLCA |
Dioxolithocholic acid |
43 |
TDHCA |
Taurodehydrocholic acid |
|
20 |
6,7-DKLCA |
6,7-Diketolithocholic acid |
44 |
α-TMCA |
Tauro-α-muricholic acid |
|
21 |
7-KDCA |
7-Ketodeoxycholic acid |
45 |
β-TMCA |
Tauro-β-muricholic acid |
|
22 |
β-MCA |
β-Muricholic acid |
46 |
λ-TMCA |
Tauro-λ-muricholic acid |
|
23 |
3-DHCA |
3-Dehydrocholic acid |
47 |
ω-TMCA |
Tauro-ω-muricholic acid |
|
24 |
UCA |
Ursocholic acid |
48 |
GCA |
Glycocholic acid |
|
序号 |
常用名 |
中文名字 |
|---|---|---|
|
1 |
NAD+ |
氧化烟酰胺腺嘌呤二核苷酸 |
|
2 |
NADP+ |
氧化烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸 |
|
3 |
NADH |
还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸 |
|
4 |
NADPH |
还原型酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸 |
|
5 |
ATP |
三磷酸腺苷 |
|
6 |
ADP |
二磷酸腺苷 |
|
7 |
AMP |
一磷酸腺苷 |
|
8 |
Creatinephosphate |
磷酸肌酸 |
|
9 |
Creatine |
肌酸 |
|
10 |
Creatinine |
肌苷 |
|
11 |
2'-deoxyuridine |
脱氧尿苷 |
|
12 |
Cytosine |
胞嘧啶 |
|
13 |
Adenosine |
腺苷 |
|
14 |
Thymine |
胸腺嘧啶 |
|
15 |
Cytidine |
胞啶 |
|
16 |
Uridine |
尿苷 |
|
17 |
Guanosine |
鸟苷 |
|
18 |
UMP |
尿苷酸 |
|
物质类别 |
物质列表 |
|---|---|
|
Sulfonamides （磺胺类：30种） |
sulfapyridine, sulfadoxine, sulfathiazole, sulfamethizole, sulfamethazine, sulfadiazine, sulfaquinoxaline, sulfachloro pyridazine, sulfisomidine, sulfadimethoxine, sulfaguanidine, sulfanilamide, sulfacetamide, sulfamerazine, sulfamoxole, succinylsulfathiazole, sulfamethoxazole, sulfamethoxypyridazine, sulfamonomethoxine, sulfisoxazole, sulfanitran, sulfaclozine , sulfameter , trimethoprim, sulfasalazine, N-acetylsulfapyridine, N-acetylsulfadiazine, N-acetylsulfamethazine, N-acetylsulfamethoxazole, N-acetylsulfamerazine |
|
Quinolones （喹诺酮类：20种） |
enrofloxacin, ciprofloxacin, danofloxacin, difloxacin, enoxacin, lomefloxacin, norfloxacin, ofloxacin, pefloxacin, sarafloxacin, sparfloxacin, cinoxacin, moxifloxacin, flumequine, pipemidic acid, nalidixic acid, fleroxacin, oxolinic acid, piromidic acid, levofloxacin |
|
Tetracyclines （四环素类：14种） |
oxytetracycline, tetracycline, chlortetracycline, minocycline, methacycline, doxycycline, 4-epianhydrotetracycline, Isochlortetracycline, 4-epitetracycline, anhydrotetracycline, 4-epianhydrochlortetracycline, 4-epioxytetracycline, α-apo-oxytetracycline, β-apo-oxytetracycline |
|
Macrolides （大环内酯类：16种） |
erythromycin, clarithromycin, clindamycin, roxithromycin, tilmicosin, lincomycin, ormetoprim, oleandomycin, azithromycin, virginiamycin M1, virginiamycin S1, kitasamycin, spiramycin, tylosin, midecamycin, midecamycin |
|
β-lactams （β-内酰胺类：14种） |
Cefalexin, cefradine, cefotaxime, ampicillin, amoxicillin, dicloxacillin, cefazolin, cloxacillin, cefaclor, penicillin V, cefapirin, piperacillin, ceftiofur, penicillin G |
|
Chloramphenicols （氯霉素类：3种） |
chloramphenicol, thiamphenicol, florfenicol |
|
Polypeptides and other antibiotics （多肽和其他抗生素：8种） |
bacitracin A, colistin A, colistin B, furazolidone, monensin, salinomycin, narasin, tiamulin |
项目优势
a.标准化技术平台：拥有标准化的实验操作规范和先进的技术平台，实验周期短，质量可靠；
b.拥有多种先进检测设备：拥有Aglient 7890A/5975C单四级杆气-质联用仪、Aglient 8890-7010B三重四级杆气质联用仪、SCIEX TripleTOF 5600 plus高分辨质谱仪、SCIEX QTRAP 4500和SCIEX Triple Quad 4500三重四级杆质谱系统，以及Agilent 600兆超低温核磁共振波谱仪等代谢组学分析平台；
c.专业的数据库：拥有多个商业数据库，同时建立了超过百个标准品数据库，使定性更加准确；
d.多重质控保障：分析过程采用严格的方法验证步骤，多重质控保证实验可靠；
e.给予个性化服务：拥有专业的生物信息团队和大型计算机，可以为合作伙伴给予个性化的生物信息分析服务；
f.完善的售后服务：完善的售后服务，从报告解读至文章发表，可全程给予高效高质量的服务；
g.开发种类多样：已开发出几大类常见代谢物靶向代谢组学分析，如代谢通路、靶向代谢物、植物代谢物、 有机化合物、无机化合物、氧化应激化合物等。
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