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      靶向代谢组学

      产品描述
      案例解析
      结果展示
      送样须知
      Q&A

        靶向代谢组学分析主要是以标准品为参照,对指定列表的代谢产物,特别针对一种或几种途径的代谢产物进行有针对性地、特异性地检测与分析。

        靶向代谢组学分析成功的关键因素是准确度、高通量和可靠性。虽然这类分析比代谢谱分析更为常规,但必须面对非常大量(成千上万)的样品。

        靶向代谢组学可以应用于:

        (1)验证由发现代谢组学实验提出的假说;

        (2)进行基于假说的探索性实验(通常根据最新的解释),针对特定代谢物,研究代谢模型。

       

        基本研究流程

        靶向代谢组学研究流程主要可分为样品收集、标准曲线建立、代谢物提取和分离、上机检测和数据分析等。

       

        样本类型

        血清 • 血浆 • 尿样 • 脑脊液 • 唾液 • 粪便 •微生物 • 细胞 • 植物 • 组织 • 其它

       

        服务周期

        靶向代谢组学服务和周期见下表:

      靶向代谢组学服务和周期

      平台

      仪器型号

      代谢物

      化合物数目

      检测周期

      检测价格

      GC-MS/MS

      Aglient 7890A-5975C或8890-7010B

      短链脂肪酸

      11种短链脂肪酸

      约15个工作日

      请询价

      游离脂肪酸

      37种游离脂肪酸

      UHPLC-QqQ MS

      SCIEX QTRAP 4500或Triple Quad 4500

      维生素

      12种水溶性

      约20个工作日

      请询价

      氨基酸

      32种氨基酸

      神经递质

      27种神经递质

      植物激素

      10种植物激素

      胆汁酸

      48种胆汁酸

      辅酶 18种辅酶
      抗生素 105种抗生素

       

      11种短链脂肪酸绝对定性定量分析

      序号

      中文名称

      英文名称

      分子式

      CAS号

      相对分子质量

      1

      乙酸

      acetic acid

      C2H4O2

      64-19-7

      60.05

      2

      丙酸

      propionic acid

      C3H6O2

      79-09-4

      74.08

      3

      异丁酸

      isobutyric acid

      C4H8O2

      79-31-2

      88.11

      4

      丁酸

      n-butyric acid

      C4H8O2

      107-92-6

      88.11

      5

      异戊酸

      isovaleric acid

      C5H10O2

      503-74-2

      102.13

      6

      戊酸

      n-valeric acid

      C5H10O2

      109-52-4

      102.13

      7

      4-甲基戊酸

      4-methylvaleric acid

      C6H12O2

      646-07-1

      116.16

      8

      正己酸

      hexanoic acid

      C6H12O2

      142-62-1

      116.15

      9

      2-甲基己酸

      2-methylhexanoic acid

      C7H14O2

      4536-23-6

      130.18

      10

      正庚酸

      n-heptylic acid

      C7H14O2

      111-14-8

      130.18

      11

      正辛酸

      n-octanoic acid

      C8H16O2

      124-07-2

      144.21

       

      37种游离脂肪酸绝对定性定量分析

      编号

      中文名称

      英文名称

      简写

      1

      丁酸

      butyric acid

      C4:0

      2

      己酸

      caproic acid

      C6:0

      3

      辛酸

      caprylic acid

      C8:0

      4

      癸酸

      capric acid

      C10:0

      5

      十一烷酸

      undecanoic acid

      C11:0

      6

      月桂酸

      lauric acid

      C12:0

      7

      十三烷酸

      tridecanoic acid

      C13:0

      8

      十四酸

      myristic acid

      C14:0

      9

      十四碳烯酸

      myristoleic acid

      C14:1n5

      10

      十五烷酸

      pentadecanoic acid

      C15:0

      11

      顺-10-十五碳烯酸

      cis-10-pentadecenoic acid

      C15:1n5

      12

      棕榈酸

      palmitic acid

      C16:0

      13

      棕榈油酸

      palmitoleic acid

      C16:1n7

      14

      十七烷酸

      heptadecanoic acid

      C17:0

      15

      顺-10-十七烯酸

      cis-10-heptadecenoic acid

      C17:1n7

      16

      硬脂酸

      stearic acid

      C18:0

      17

      反油酸

      elaidic acid

      C18:1n9t

      18

      油酸

      oleic acid

      C18:1n9c

      19

      反亚油酸

      linolelaidic acid

      C18:2n6t

      20

      亚油酸

      linoleic acid

      C18:2n6c

      21

      γ-亚麻酸

      r-linolenic acid

      C18:3n6

      22

      α-亚麻酸

      α-linolenic acid

      C18:3n3

      23

      花生酸

      arachidic acid

      C20:0

      24

      顺-11-二十碳烯酸

      cis-11-eicosenoic acid

      C20:1

      25

      顺-11,14-二十碳二烯酸

      cis-11,14-eicosadienoic acid

      C20:2

      26

      顺-8,11,14-二十碳三烯酸

      cis-8,11,14-eicosatrienoic acid

      C20:3n6

      27

      花生四烯酸

      arachildonic acid

      C20:4n6

      28

      二十一烷酸

      heneicosanoic acid

      C21:0

      29

      顺-11,14,17-二十碳三烯酸

      cis-11,14,17-eicosatrienoic acid

      C20:3n3

      30

      顺-5,8,11,14,17-二十碳三烯酸

      cis-5,8,11,14,17-eicosatrienoic acid

      C20:5n3

      31

      山萮酸

      behenic acid

      C22:0

      32

      芥酸

      erucic acid

      C22:1n9

      33

      顺-13,16-二十二碳二烯酸

      cis-13,16-docosadienoic acid

      C22:2

      34

      三十烷酸

      tricosanoic acid

      C23:0

      35

      顺-4,7,10,13,16,19-二十二碳六烯酸

      cis-4,7,10,13,16,19-docosahexaenoic acid

      C22:6n3

      36

      二十四碳酸

      lignceric acid

      C24:0

      37

      神经酸

      nervonic acid

      C24:1n9

       

      12种水溶性维生素绝对定性定量分析

      编号

      物质名称

      英文名称

      分子量

      1

      VB1硫胺素

      thiamine

      264.35

      2

      VB2核黄素

      Riboflavin

      376.36

      3

      VB3烟酰胺

      Nicotinamide

      122.12

      4

      VB5泛酸

      (R)-pantothenicacid

      219.24

      5

      VB6吡哆胺

      pyridoxamine

      168.19

      6

      VB6吡哆醇

      Pyridoxine

      169.18

      7

      VB6吡哆醛

      pyridoxal

      167.16

      8

      VB7生物素

      Biotin

      244.31

      9

      VB9叶酸

      folic acid

      441.40

      10

      VB12钴胺素碎片

      Vitamin B12

      1355.37

      11

      对氨基苯甲酸

      p-aminobenzoic acid

      137.14

      12

      硫辛酸

      thioctic acid

      206.33

       

      32种氨基酸绝对定性定量分析

      编号

      中文名称

      英文名称

      缩写

      1

      丙氨酸

      alanine

      ALA

      2

      肌氨酸

      sarcosine

      SAR

      3

      甘氨酸

      glycine

      GLY

      4

      α-氨基丁酸

      α-aminobutyric acid

      ABA

      5

      缬氨酸

      valine

      VAL

      6

      β-氨基异丁酸

      β-aminobutyric acid

      β-AIB

      7

      亮氨酸

      leucine

      LEU

      8

      别异亮氨酸

      allo-isoleucine

      aILE

      9

      异亮氨酸

      isoleucine

      ILE

      10

      苏氨酸

      threonine

      THR

      11

      丝氨酸

      serine

      SER

      12

      脯氨酸

      proline

      PRO

      13

      天冬酰胺

      asparagine

      ASN

      14

      硫代脯氨酸

      thioproline

      TPR

      15

      天冬氨酸

      aspartic acid

      ASP

      16

      蛋氨酸

      methionine

      MET

      17

      羟基脯氨酸

      4-hydroxyproline

      4-HYP

      18

      谷氨酸

      glutamic acid

      GLU

      19

      苯丙氨酸

      phenylalanine

      PHE

      20

      α-氨基己二酸

      ɑ-aminoadipic acid

      AAA

      21

      α-氨基庚二酸

      ɑ-aminopimelic acid

      APA

      22

      谷氨酰胺

      glutamine

      GLN

      23

      鸟氨酸

      ornithine

      ORN

      24

      甘氨酰-脯氨酸(二肽)

      glycyl-proline

      GPR

      25

      赖氨酸

      lysine

      LYS

      26

      组氨酸

      histidine

      HIS

      27

      羟基赖氨酸

      hydroxylysine

      HLY

      28

      酪氨酸

      trrosinre

      TYR

      29

      脯氨酸-羟基脯氨酸(二肽)

      proline-hydroxyproline

      PHP

      30

      色氨酸

      tryptophan

      TRP

      31

      胱硫醚

      cystathionine

      CTH

      32

      胱氨酸

      cystine

      C-C

       

      27种神经递质绝对定性定量分析

      编号

      中文名字

      英文名字

      缩写

      分类

      CAS号

      1

      色胺

      Tryptamine

      -

      单胺类吲哚类

      61-54-1

      2

      5-羟色胺

      Serotonin hydrochloride

      5-HT

      单胺类吲哚类

      153-98-0

      3

      5-羟吲哚乙酸

      5-hydroxyindoleacetic acid

      5HIAA

      单胺类吲哚类

      54-16-0

      4

      犬尿喹啉酸

      Kynurenic acid

      KYNA

      单胺类吲哚类

      492-27-3

      5

      褪黑激素

      Melatonin

      -

      单胺吲哚类

      73-31-4

      6

      5-羟基色氨酸

      5-Hydroxy-Tryptophan

      5-HTP

      单胺吲哚类

      4350-09-8

      7

      肾上腺素

      Epinephrine

      EP

      单胺类儿茶酚胺类

      329-63-5

      8

      去甲肾上腺素

      noradrenaline bitartrate

      NE

      单胺类儿茶酚胺类

      108341-18-0

      9

      多巴胺

      Dopamine

      DA

      单胺类儿茶酚胺类

      62-31-7

      10

      高香草酸

      homovanillic acid

      NMN

      单胺类儿茶酚胺类

      306-08-1

      11

      香草扁桃酸

      4-hydroxy-S-methoxymandelic acid

      VM-A

      单胺类儿茶酚胺类

      55-10-7

      12

      去甲变肾上腺素

      rac Normetanephrine

      -

      单胺类儿茶酚胺类

      1011-74-1

      13

      3-甲氧酪胺

      3-Methoxy-p-tyramine

      -

      单胺类儿茶酚胺类

      1477-68-5

      14

      酪胺

      Tyramine

      -

      单胺类儿茶酚胺类

      51-67-2

      15

      二羟苯乙酸

      3,4-Dihydroxyphenylacetic acid

      DOPAC

      单胺类儿茶酚胺类

      102-32-9

      16

      胆碱

      Choline Chloride

      -

      单胺类胆碱类

      67-48-1

      17

      乙酰胆碱

      Acetylcholine

      Ach

      单胺类胆碱类

      60-31-1

      18

      组胺

      Histamine

      -

      氨基酸类

      51-45-6

      19

      犬尿氨酸

      Kynurenine

      -

      氨基酸类

      2922-83-0

      20

      谷氨酰胺

      Glutamine

      GLN

      氨基酸类

      56-85-9

      21

      谷氨酸

      Glutamic Acid

      GLU

      氨基酸类

      56-86-0

      22

      4-氨基丁酸

      4-Aminobutyric Acid

      GABA

      氨基酸类

      56-12-2

      23

      酪氨酸

      Tyrosine

      TYR

      氨基酸类

      60-18-4

      24

      精氨酸

      Arginine

      Arg

      氨基酸类

      74-79-3

      25

      组氨酸

      Histidine

      HIS

      氨基酸类

      71-00-1

      26

      苯基丙氨酸

      Phenylalanine

      PHE

      氨基酸类

      63-91-2

      27

      色氨酸

      Tryptophan

      TRP

      氨基酸类

      73-22-3

       

      10种植物激素绝对定性定量分析

      编号

      中文名

      英文名

      简称

      1

      反-玉米素

      Trans-Zeatin

      t-ZT

      2

      赤霉素

      Gibberellin A3

      GA3

      3

      吲哚乙酸

      3-Indoleacetic acid

      IAA

      4

      水杨酸

      Salicylic acid

      SA

      5

      茉莉酸

      Jasmonic acid

      JA

      6

      脱落酸

      Abscisic acid

      ABA

      7

      吲哚丁酸

      3-Indolebutyric acid

      IBA

      8

      6-苄氨基嘌呤

      6-Benzylaminopurine

      6-BA

      9

      茉莉酸甲酯

      Methyl jasmonate

      JA-ME

      10

      激动素

      6-Furfurylaminopurine

      6-KT

       

      48种胆汁酸绝对定性定量分析

      编号

      简称

      常用名

      编号

      简称

      常用名

      1

      DLCA

      Dehydrolithocholic acid

      25

      3β-CA

      3β-Cholic Acid

      2

      LCA

      Lithocholic acid

      26

      α-MCA

      α-Muricholic acid

      3

      ILCA

      Isolithocholic acid

      27

      12-DHCA

      12-Dehydrocholic acid

      4

      NDCA

      23-Nordeoxycholic acid

      28

      λ-MCA (HCA)

      λ-Muricholic acid

      5

      6-KLCA

      6-Ketolithocholic acid

      29

      CA

      Cholic acid

      6

      7-KLCA

      7-Ketolithocholic acid

      30

      AlCA

      Allocholic acid

      7

      12-KLCA

      12-Ketolithocholic acid

      31

      GLCA

      Glycolithocholic acid

      8

      ApCA

      Apocholic acid

      32

      GCDCA

      Glycochenodeoxycholic acid

      9

      MoCA

      Murocholic acid

      33

      TLCA

      Taurolithocholic acid

      10

      TCDCA-d5

      Taurochenodeoxycholic-d5 acid

      34

      GHDCA

      Glycohyodeoxycholic acid

      11

      β-HDCA

      β-Hyodeoxycholic Acid

      35

      GDHCA

      Glycodehydrocholic acid

      12

      UDCA

      Ursodeoxycholic acid

      36

      λ-GMCA (GHCA)

      Glyco-λ-muricholic acid

      13

      CDCA

      Chenodeoxycholic acid

      37

      TDCA

      Taurodeoxycholic acid

      14

      DHCA

      Dehydrocholic acid

      38

      GUDCA

      Glycoursodeoxycholic acid

      15

      HDCA

      Hyodeoxycholic acid

      39

      TUDCA

      Tauroursodeoxycholic acid

      16

      IDCA

      Isodeoxycholic acid

      40

      THDCA

      Taurohyodeoxycholic acid

      17

      NCA

      23-Norcholic acid

      41

      TCA

      Taurocholic acid

      18

      DCA

      Deoxycholic acid

      42

      GDCA

      Glycodeoxycholic acid

      19

      DiLCA

      Dioxolithocholic acid

      43

      TDHCA

      Taurodehydrocholic acid

      20

      6,7-DKLCA

      6,7-Diketolithocholic acid

      44

      α-TMCA

      Tauro-α-muricholic acid

      21

      7-KDCA

      7-Ketodeoxycholic acid

      45

      β-TMCA

      Tauro-β-muricholic acid

      22

      β-MCA

      β-Muricholic acid

      46

      λ-TMCA

      Tauro-λ-muricholic acid

      23

      3-DHCA

      3-Dehydrocholic acid

      47

      ω-TMCA

      Tauro-ω-muricholic acid

      24

      UCA

      Ursocholic acid

      48

      GCA

      Glycocholic acid

       

      18种辅酶绝对定性定量分析

      序号

      常用名

      中文名字

      1

      NAD+

      氧化烟酰胺腺嘌呤二核苷酸

      2

      NADP+

      氧化烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸

      3

      NADH

      还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸

      4

      NADPH

      还原型酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸

      5

      ATP

      三磷酸腺苷

      6

      ADP

      二磷酸腺苷

      7

      AMP

      一磷酸腺苷

      8

      Creatinephosphate

      磷酸肌酸

      9

      Creatine

      肌酸

      10

      Creatinine

      肌苷

      11

      2'-deoxyuridine

      脱氧尿苷

      12

      Cytosine

      胞嘧啶

      13

      Adenosine

      腺苷

      14

      Thymine

      胸腺嘧啶

      15

      Cytidine

      胞啶

      16

      Uridine

      尿苷

      17

      Guanosine

      鸟苷

      18

      UMP

      尿苷酸

       

      105种抗生素绝对定性定量分析

      物质类别

      物质列表

      Sulfonamides

      (磺胺类:30种)

      sulfapyridine, sulfadoxine, sulfathiazole, sulfamethizole, sulfamethazine, sulfadiazine, sulfaquinoxaline, sulfachloro pyridazine, sulfisomidine, sulfadimethoxine, sulfaguanidine, sulfanilamide, sulfacetamide, sulfamerazine, sulfamoxole, succinylsulfathiazole, sulfamethoxazole, sulfamethoxypyridazine, sulfamonomethoxine, sulfisoxazole, sulfanitran, sulfaclozine , sulfameter , trimethoprim, sulfasalazine, N-acetylsulfapyridine, N-acetylsulfadiazine, N-acetylsulfamethazine, N-acetylsulfamethoxazole, N-acetylsulfamerazine

      Quinolones

      (喹诺酮类:20种)

      enrofloxacin, ciprofloxacin, danofloxacin, difloxacin, enoxacin, lomefloxacin, norfloxacin, ofloxacin, pefloxacin, sarafloxacin, sparfloxacin, cinoxacin, moxifloxacin, flumequine, pipemidic acid, nalidixic acid, fleroxacin, oxolinic acid, piromidic acid, levofloxacin

      Tetracyclines

      (四环素类:14种)

      oxytetracycline, tetracycline, chlortetracycline, minocycline, methacycline, doxycycline, 4-epianhydrotetracycline, Isochlortetracycline, 4-epitetracycline, anhydrotetracycline, 4-epianhydrochlortetracycline, 4-epioxytetracycline, α-apo-oxytetracycline, β-apo-oxytetracycline

      Macrolides

      (大环内酯类:16种)

      erythromycin, clarithromycin, clindamycin, roxithromycin, tilmicosin, lincomycin, ormetoprim, oleandomycin, azithromycin, virginiamycin M1, virginiamycin S1, kitasamycin, spiramycin, tylosin, midecamycin, midecamycin

      β-lactams

      (β-内酰胺类:14种)

      Cefalexin, cefradine, cefotaxime, ampicillin, amoxicillin, dicloxacillin, cefazolin, cloxacillin, cefaclor, penicillin V, cefapirin, piperacillin, ceftiofur, penicillin G

      Chloramphenicols

      (氯霉素类:3种)

      chloramphenicol, thiamphenicol, florfenicol

      Polypeptides and other antibiotics

      (多肽和其他抗生素:8种)

      bacitracin A, colistin A, colistin B, furazolidone, monensin, salinomycin, narasin, tiamulin

        

      项目优势

        a.标准化技术平台:拥有标准化的实验操作规范和先进的技术平台,实验周期短,质量可靠;

        b.拥有多种先进检测设备:拥有Aglient 7890A/5975C单四级杆气-质联用仪、Aglient 8890-7010B三重四级杆气质联用仪、SCIEX TripleTOF 5600 plus高分辨质谱仪、SCIEX QTRAP 4500和SCIEX Triple Quad 4500三重四级杆质谱系统,以及Agilent 600兆超低温核磁共振波谱仪等代谢组学分析平台;

        c.专业的数据库:拥有多个商业数据库,同时建立了超过百个标准品数据库,使定性更加准确;

        d.多重质控保障:分析过程采用严格的方法验证步骤,多重质控保证实验可靠;

        e.给予个性化服务:拥有专业的生物信息团队和大型计算机,可以为合作伙伴给予个性化的生物信息分析服务;

        f.完善的售后服务:完善的售后服务,从报告解读至文章发表,可全程给予高效高质量的服务;

        g.开发种类多样:已开发出几大类常见代谢物靶向代谢组学分析,如代谢通路、靶向代谢物、植物代谢物、 有机化合物、无机化合物、氧化应激化合物等。

        文献:Mathé EA, et al., Noninvasive urinary metabolomic profiling identifies diagnostic and prognostic markers in lungcancer. 2014, Cancer Research, 74(12):3259-70 (IF=9.32)

        

      实验材料:

        前期筛选样本(1005例):花费十年(1998~2007)收集样本:469例病人(治疗前尿液)+536例健康人

        后期验证样本(158例):近期(2008–2010)收集的样本:80例病人(治疗前尿液)+78例健康人

        组织样品:48例肿瘤组织及其周边非肿瘤组织

       

        研究流程:

        概述:前期非靶筛选+后期靶向MRM验证

       

        实验流程:

       

      1

       

        研究结论:

        前期筛选:前期筛选样品的非靶向代谢组学分析,正离子模式下共检测到1807个信号,负离子检测到1359个。顺利获得对吸烟相关代谢物(Cotinine、Nicotine-N’-oxide和Trans-3’-hydroxycotinine)的检测,发现可以很好的将吸烟人群与非吸烟人群区分开,验证了分析方法的可行性。

       

      1

       

        数据分析:

        a.诊断与分型研究:应用统计学分析方法,排除人种和性别的干扰后,作者鉴定到了四个差异代谢物:NANA、Cortisol sulfate、Creatine riboside 和 561+(未鉴定物质)。ROC分析发现四个差异代谢物在所有人群中AUC值在0.63~0.76之间,在I-II期肺癌人群中在0.59~0.70之间。其中用Creatine riboside或者全部四种代谢物预测更加准确(P<0.00001)。

       

      1

        Overlap between signals that are predictive of lung cancer status in the training set based on the Random Forests classification.

       

      1

        Receiver Operating Characteristic (ROC) analysis of individual metabolites and their combination

       

        b.预后研究:在综合考虑了性别、人种、疾病阶段、组织切片、吸烟史、放化疗、外科手术等多方面因素后作者发现高含量的NANA、Cortisol sulfate、Creatine riboside和561+带来不好的预后效果(存活率低),而且这四种代谢物与存活率的相关性是独立的但却有累加效应;在I-II期肺癌人群中,高含量的Creatine riboside和561+也会降低病人的存活率。

       

      1

        Kaplan-Meier survival estimates in the training set are depicted for the top four predictive metabolites

        c.后期验证:同样使用非靶向代谢组学方法,发现在验证人群(80例病人+78例健康人)中Creatine riboside、NANA和561+在病人尿液中的含量都有显著升高。在排除年龄、性别与人种干扰后选择198例样品(92例病人+106例健康人)进行靶向代谢组学,验证了这四种代谢物与疾病的相关性。此外,为证明这四种代谢物的稳定性,作者样品保存两年后再次重复了实验,证明它们临床应用的价值。

       

      1

        Abundance and validation of metabolites that were top contributors in the classification of patients as lung cancer or healthy controls.

        d.机理研究方面的延伸:作者最后在肿瘤组织中检测上述四种代谢物的含量,发现与邻近组织相比,肿瘤组织中Creatine riboside和NANA的含量明显升高,同时Creatine的含量也有增加。

       

      1

        Linking urinary metabolites to lung cancer tissue metabolome.

        总结:

        本篇文章是非常经典的代谢组生物标志物研究范例,前期非靶向的筛选加上后期的靶向验证,非常值得借鉴学习。

        文章最后从体液类样品再次回归组织类样品,叩开了后期机理研究的大门,这种研究思路也非常值得临床研究借鉴。

      持续更新中,敬请期待...

        1.代谢组学送样量参考标准

      检测策略/方法

      血样

      尿液

      脑脊液

      粪便 

      微生物

      细胞

      组织

      植物

      非靶向代谢组

      500ul

      1ml

      200ul

      2g

      250mg

      107

      250mg

      250mg

      靶向代谢组

      500ul

      1ml

      200ul

      2g

      250mg

      107

      250mg

      250mg

      NMR代谢组

      500ul

      1ml

      500ul

      2g

      500mg

      107

      500mg

      500mg

       

        2.代谢组学送样生物学重复性要求

        代谢组的差异变化是基因组变化放大效应的呈现,不同个体中代谢物的波动性也就较大。另一方面,代谢组学的差异分析一般是基于PCA和PLS-DA等多元统计分析方法进行的,只有较大的样本量抽提出的主成分才具有群体代表性。因此,相对于基因组学等技术方法,代谢组学要求样品的生物学重复要更多。

        a.临床标本大于30例;

        b.模式动物样品大于10例;

        c.植物微生物样品每组大于8例;

        d.细胞样品大于6例。

       

        3.代谢组学送样品收集标准

      样本类型

      收集标准

      血液

      血清

      静脉抽血3~4mL,置于采血管内(不放置任何抗凝剂及促凝剂);4℃静置30~60min(不超过2h),待血液凝固;3500rpm、4℃,离心10 分钟,待血细胞完全沉降后,吸取上层血清,保存于-80℃保存。

      血浆

      采集血液样本,置于含有适量抗凝剂(慎用Citrate 抗凝剂;NMR检测推荐用Heprin抗凝剂;质谱检测推荐用EDTA抗凝剂(K2、K3、Na、绝对不有Li)的采集管内;反复颠倒采血管,使抗凝剂与血液充分混匀;以2000-3000rpm离心10 min(血样采集后室温放置1h之内进行离心;血样采集后冰上放置可以在4 h内进行处理),上清液即为血浆;保存于-80℃冰箱。

      尿液

       收集尿液(严禁加入叠氮钠等抑菌剂以免对质谱测试产生干扰)置离心管(推荐用PP材料)中,10000rpm、4℃,离心10 分钟,取上清液,置-80℃保存。建议在送样代谢组学 检测同时进行尿肌酐的检测。

      其它体液样本

      收集过程尽量不添加其它试剂,收集至离心管后液氮速冻,置-80℃保存。

      细胞

      贴壁细胞(每皿细胞量不少于1.0E7)

      处理前将每皿细胞计数,弃去培养皿中的培养液,每皿加入10ml 去离子水洗去培养基,震摇2s(不要过于激烈,防止细胞破裂),加入15ml 的液氮淬灭(2mins),加入1.5ml,-80℃预冰的甲醇, 用刮刀刮。

      不贴壁的细胞

      将混悬液完整转移至1.5ml 的离心管中,4 °C,13000rpm 离心10min,取固定体积上清液(每皿取等量体积,尽量多取,比如0.8mL), 置1.5mL 离心管中,置-80℃保存。同时,将细胞碎片称重予以记录。

      细胞培养液(2mL/例)

      将每皿待测细胞培养液吸取固定体积,置2mL 离心管, 10000rpm、4℃,离心10 分钟,取上清液,-80℃保存。

      粪便

       从粪便的不同部位挑取3个点,称重,置离心管中(严禁加入叠氮钠等抑菌剂以免对质谱测试产生干扰),-80℃保存。

      组织

      动物组织样本

      全程冰上操作,尽量减少操作时间。去除血液(心、肝、肾、 肺可行心脏灌流,其他组织可用预冷PBS 淋洗数次)干扰,置液氮速冻,-80℃ 保存。

      人组织样本及肿瘤样本

      尽量减少操作时间。去除血液(预冷PBS 淋洗数次)干扰,置液氮速冻,-80℃保存。

      微生物及菌类样本

      收集107个/例细菌或500mg/例菌丝于离心管内,若菌丝无法判断具体量,可以黄豆粒大小为标准,迅速液氮速冻,-80℃保存。

      植物样本

      建议粉碎后称重,液氮速冻,-80℃保存。也可寄送未粉碎样品。

       

      持续更新中,敬请期待...

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